Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DccP70211 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DccP70211 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DccP70211 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DccP70211 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DccP70211 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DccP70211 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DccP70211 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DccP70211 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DccP70211 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DccP70211 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DccP70211 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DccP70211 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DccP70211 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DccP70211 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
DccP70211 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
DccP70211 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DccP70211 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DccP70211 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DccP70211 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
DccP70211 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DccP70211 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DccP70211 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DccP70211 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DccP70211 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DccP70211 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DccP70211 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DccP70211 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DccP70211 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DccP70211 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DccP70211 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
DccP70211 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DccP70211 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DccP70211 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DccP70211 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DccP70211 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DccP70211 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DccP70211 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DccP70211 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DccP70211 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DccP70211 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DccP70211 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DccP70211 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DccP70211 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DccP70211 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DccP70211 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DccP70211 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DccP70211 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DccP70211 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DccP70211 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DccP70211 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DccP70211 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DccP70211 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DccP70211 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DccP70211 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DccP70211 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DccP70211 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DccP70211 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DccP70211 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DccP70211 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DccP70211 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DccP70211 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DccP70211 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DccP70211 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DccP70211 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DccP70211 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DccP70211 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DccP70211 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DccP70211 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DccP70211 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
DccP70211 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
DccP70211 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DccP70211 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DccP70211 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DccP70211 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DccP70211 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DccP70211 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DccP70211 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DccP70211 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DccP70211 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DccP70211 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DccP70211 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DccP70211 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DccP70211 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DccP70211 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DccP70211 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DccP70211 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DccP70211 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DccP70211 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DccP70211 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DccP70211 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DccP70211 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DccP70211 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DccP70211 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DccP70211 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DccP70211 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DccP70211 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DccP70211 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DccP70211 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DccP70211 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms