Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrig1P70193 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 392.2 ms