Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acta1P68134 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Acta1P68134 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acta1P68134 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acta1P68134 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta1P68134 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acta1P68134 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acta1P68134 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acta1P68134 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms