Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps17P63276 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps17P63276 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps17P63276 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps17P63276 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps17P63276 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps17P63276 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps17P63276 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps17P63276 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps17P63276 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps17P63276 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps17P63276 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps17P63276 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps17P63276 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms