Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crip1P63254 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crip1P63254 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crip1P63254 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crip1P63254 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crip1P63254 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crip1P63254 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crip1P63254 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crip1P63254 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crip1P63254 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crip1P63254 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crip1P63254 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crip1P63254 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms