Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmgb1P63158 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms