Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rpl39P62892 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl39P62892 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl39P62892 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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