Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl30P62889 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl30P62889 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpl30P62889 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpl30P62889 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms