Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acta2P62737 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acta2P62737 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acta2P62737 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acta2P62737 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Acta2P62737 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acta2P62737 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acta2P62737 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acta2P62737 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms