Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lsm5P62322 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lsm5P62322 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lsm5P62322 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lsm5P62322 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lsm5P62322 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lsm5P62322 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lsm5P62322 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm5P62322 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.7 ms