Protein–RNA interactions for Protein: P62196

Psmc5, 26S proteasome regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc5P62196 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc5P62196 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmc5P62196 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms