Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp46P62069 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp46P62069 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp46P62069 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp46P62069 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Usp46P62069 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp46P62069 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp46P62069 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp46P62069 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp46P62069 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp46P62069 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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