Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Psme3P61290 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psme3P61290 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme3P61290 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme3P61290 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme3P61290 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme3P61290 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme3P61290 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme3P61290 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme3P61290 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms