Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx1bP61264 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stx1bP61264 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx1bP61264 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms