Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdo1P60334 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdo1P60334 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdo1P60334 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdo1P60334 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdo1P60334 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdo1P60334 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdo1P60334 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdo1P60334 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdo1P60334 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdo1P60334 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdo1P60334 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdo1P60334 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdo1P60334 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdo1P60334 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdo1P60334 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdo1P60334 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdo1P60334 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdo1P60334 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdo1P60334 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdo1P60334 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdo1P60334 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdo1P60334 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdo1P60334 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdo1P60334 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdo1P60334 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cdo1P60334 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdo1P60334 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdo1P60334 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdo1P60334 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdo1P60334 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdo1P60334 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdo1P60334 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdo1P60334 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdo1P60334 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdo1P60334 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdo1P60334 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdo1P60334 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdo1P60334 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdo1P60334 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cdo1P60334 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdo1P60334 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cdo1P60334 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdo1P60334 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdo1P60334 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdo1P60334 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdo1P60334 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms