Protein–RNA interactions for Protein: P59280

Klhl8, Kelch-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl8P59280 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl8P59280 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl8P59280 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl8P59280 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl8P59280 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl8P59280 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl8P59280 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl8P59280 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl8P59280 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl8P59280 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl8P59280 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl8P59280 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl8P59280 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl8P59280 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl8P59280 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl8P59280 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl8P59280 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl8P59280 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl8P59280 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms