Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Csrnp1P59054 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Csrnp1P59054 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Csrnp1P59054 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Csrnp1P59054 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Csrnp1P59054 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csrnp1P59054 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csrnp1P59054 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csrnp1P59054 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csrnp1P59054 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csrnp1P59054 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csrnp1P59054 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Csrnp1P59054 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Csrnp1P59054 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms