Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pdrg1P59048 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdrg1P59048 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms