Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd4P58467 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Setd4P58467 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Setd4P58467 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Setd4P58467 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Setd4P58467 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Setd4P58467 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Setd4P58467 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Setd4P58467 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Setd4P58467 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Setd4P58467 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms