Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctdsp1P58466 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctdsp1P58466 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms