Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Strn4P58404 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Strn4P58404 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Strn4P58404 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Strn4P58404 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Strn4P58404 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Strn4P58404 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Strn4P58404 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Strn4P58404 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Strn4P58404 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Strn4P58404 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms