Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NcstnP57716 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NcstnP57716 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NcstnP57716 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NcstnP57716 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NcstnP57716 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NcstnP57716 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NcstnP57716 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NcstnP57716 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NcstnP57716 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.8 ms