Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp25P57080 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp25P57080 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp25P57080 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp25P57080 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp25P57080 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp25P57080 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp25P57080 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp25P57080 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp25P57080 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp25P57080 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms