Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Exosc10P56960 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc10P56960 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Exosc10P56960 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Exosc10P56960 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Exosc10P56960 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Exosc10P56960 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Exosc10P56960 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Exosc10P56960 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Exosc10P56960 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Exosc10P56960 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Exosc10P56960 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc10P56960 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc10P56960 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc10P56960 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc10P56960 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc10P56960 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms