Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp2c40P56657 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp2c40P56657 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp2c40P56657 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp2c40P56657 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp2c40P56657 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp2c40P56657 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp2c40P56657 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp2c40P56657 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp2c40P56657 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp2c40P56657 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp2c40P56657 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp2c40P56657 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp2c40P56657 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp2c40P56657 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp2c40P56657 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp2c40P56657 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp2c40P56657 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp2c40P56657 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp2c40P56657 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp2c40P56657 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp2c40P56657 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp2c40P56657 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp2c40P56657 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp2c40P56657 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp2c40P56657 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp2c40P56657 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp2c40P56657 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp2c40P56657 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp2c40P56657 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp2c40P56657 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp2c40P56657 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp2c40P56657 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms