Protein–RNA interactions for Protein: P56391

Cox6b1, Cytochrome c oxidase subunit 6B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6b1P56391 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox6b1P56391 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms