Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CtskP55097 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtskP55097 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtskP55097 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtskP55097 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CtskP55097 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtskP55097 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtskP55097 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtskP55097 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtskP55097 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtskP55097 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtskP55097 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtskP55097 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtskP55097 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtskP55097 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtskP55097 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtskP55097 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtskP55097 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtskP55097 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtskP55097 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtskP55097 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtskP55097 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtskP55097 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtskP55097 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtskP55097 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtskP55097 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtskP55097 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtskP55097 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtskP55097 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtskP55097 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtskP55097 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtskP55097 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtskP55097 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtskP55097 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtskP55097 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtskP55097 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtskP55097 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtskP55097 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtskP55097 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtskP55097 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtskP55097 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtskP55097 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtskP55097 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CtskP55097 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtskP55097 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtskP55097 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtskP55097 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CtskP55097 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtskP55097 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CtskP55097 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CtskP55097 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CtskP55097 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtskP55097 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtskP55097 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtskP55097 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtskP55097 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtskP55097 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtskP55097 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtskP55097 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtskP55097 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtskP55097 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtskP55097 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtskP55097 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtskP55097 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtskP55097 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtskP55097 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtskP55097 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtskP55097 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtskP55097 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtskP55097 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtskP55097 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CtskP55097 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtskP55097 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtskP55097 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtskP55097 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtskP55097 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtskP55097 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtskP55097 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtskP55097 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtskP55097 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtskP55097 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtskP55097 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtskP55097 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtskP55097 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtskP55097 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtskP55097 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtskP55097 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtskP55097 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtskP55097 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtskP55097 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtskP55097 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtskP55097 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtskP55097 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CtskP55097 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtskP55097 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtskP55097 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtskP55097 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtskP55097 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtskP55097 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtskP55097 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms