Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aqp4P55088 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aqp4P55088 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms