Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GemP55041 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GemP55041 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GemP55041 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GemP55041 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GemP55041 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GemP55041 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GemP55041 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GemP55041 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GemP55041 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GemP55041 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GemP55041 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GemP55041 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GemP55041 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GemP55041 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GemP55041 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GemP55041 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GemP55041 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GemP55041 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GemP55041 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GemP55041 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GemP55041 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GemP55041 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GemP55041 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GemP55041 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GemP55041 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GemP55041 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GemP55041 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GemP55041 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GemP55041 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GemP55041 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GemP55041 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GemP55041 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GemP55041 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GemP55041 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GemP55041 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GemP55041 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GemP55041 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GemP55041 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GemP55041 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GemP55041 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GemP55041 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GemP55041 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GemP55041 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GemP55041 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
GemP55041 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GemP55041 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GemP55041 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GemP55041 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GemP55041 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GemP55041 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GemP55041 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GemP55041 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GemP55041 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GemP55041 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GemP55041 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GemP55041 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GemP55041 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GemP55041 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GemP55041 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GemP55041 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GemP55041 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GemP55041 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GemP55041 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GemP55041 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GemP55041 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GemP55041 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GemP55041 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GemP55041 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GemP55041 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GemP55041 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GemP55041 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GemP55041 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GemP55041 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GemP55041 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GemP55041 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GemP55041 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GemP55041 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GemP55041 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GemP55041 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GemP55041 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GemP55041 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GemP55041 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GemP55041 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GemP55041 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GemP55041 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GemP55041 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GemP55041 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GemP55041 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GemP55041 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GemP55041 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GemP55041 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GemP55041 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GemP55041 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GemP55041 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GemP55041 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GemP55041 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GemP55041 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GemP55041 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GemP55041 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms