Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad23aP54726 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad23aP54726 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms