Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgf9P54130 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgf9P54130 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf9P54130 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms