Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cux1P53564 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cux1P53564 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cux1P53564 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cux1P53564 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cux1P53564 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cux1P53564 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Cux1P53564 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cux1P53564 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cux1P53564 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cux1P53564 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cux1P53564 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cux1P53564 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cux1P53564 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cux1P53564 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Cux1P53564 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cux1P53564 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cux1P53564 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Cux1P53564 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cux1P53564 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cux1P53564 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cux1P53564 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cux1P53564 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cux1P53564 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cux1P53564 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cux1P53564 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cux1P53564 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cux1P53564 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cux1P53564 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cux1P53564 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cux1P53564 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cux1P53564 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cux1P53564 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cux1P53564 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cux1P53564 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cux1P53564 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cux1P53564 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Cux1P53564 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cux1P53564 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cux1P53564 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cux1P53564 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cux1P53564 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cux1P53564 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cux1P53564 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cux1P53564 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cux1P53564 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cux1P53564 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cux1P53564 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cux1P53564 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Cux1P53564 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cux1P53564 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cux1P53564 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cux1P53564 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cux1P53564 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms