Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Epb41l4aP52963 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Epb41l4aP52963 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Epb41l4aP52963 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Epb41l4aP52963 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Epb41l4aP52963 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Epb41l4aP52963 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Epb41l4aP52963 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epb41l4aP52963 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Epb41l4aP52963 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Epb41l4aP52963 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Epb41l4aP52963 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Epb41l4aP52963 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Epb41l4aP52963 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Epb41l4aP52963 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Epb41l4aP52963 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms