Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ube2e3P52483 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ube2e3P52483 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube2e3P52483 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube2e3P52483 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube2e3P52483 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube2e3P52483 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2e3P52483 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2e3P52483 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2e3P52483 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2e3P52483 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2e3P52483 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2e3P52483 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2e3P52483 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2e3P52483 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2e3P52483 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2e3P52483 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2e3P52483 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2e3P52483 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms