Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp10P52479 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp10P52479 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp10P52479 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp10P52479 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp10P52479 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp10P52479 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp10P52479 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp10P52479 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp10P52479 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp10P52479 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp10P52479 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp10P52479 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp10P52479 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp10P52479 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp10P52479 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp10P52479 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp10P52479 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp10P52479 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp10P52479 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp10P52479 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp10P52479 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp10P52479 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp10P52479 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp10P52479 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms