Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Defa-rs12P50716 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Defa-rs12P50716 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Defa-rs12P50716 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Defa-rs12P50716 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Defa-rs12P50716 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Defa-rs12P50716 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Defa-rs12P50716 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Defa-rs12P50716 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Defa-rs12P50716 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Defa-rs12P50716 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Defa-rs12P50716 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Defa-rs12P50716 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Defa-rs12P50716 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Defa-rs12P50716 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Defa-rs12P50716 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Defa-rs12P50716 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Defa-rs12P50716 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Defa-rs12P50716 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Defa-rs12P50716 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms