Protein–RNA interactions for Protein: P50707

Defa9, Alpha-defensin 9, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa9P50707 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa9P50707 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa9P50707 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa9P50707 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa9P50707 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa9P50707 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa9P50707 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa9P50707 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa9P50707 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms