Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa6P50704 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa6P50704 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa6P50704 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa6P50704 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa6P50704 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa6P50704 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa6P50704 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms