Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TspoP50637 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TspoP50637 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TspoP50637 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TspoP50637 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TspoP50637 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TspoP50637 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TspoP50637 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TspoP50637 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TspoP50637 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TspoP50637 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TspoP50637 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TspoP50637 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TspoP50637 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TspoP50637 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TspoP50637 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TspoP50637 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TspoP50637 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TspoP50637 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TspoP50637 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TspoP50637 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TspoP50637 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TspoP50637 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TspoP50637 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TspoP50637 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TspoP50637 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TspoP50637 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TspoP50637 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TspoP50637 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TspoP50637 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TspoP50637 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TspoP50637 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TspoP50637 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TspoP50637 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TspoP50637 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TspoP50637 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TspoP50637 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TspoP50637 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TspoP50637 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TspoP50637 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TspoP50637 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TspoP50637 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TspoP50637 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TspoP50637 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TspoP50637 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TspoP50637 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TspoP50637 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TspoP50637 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TspoP50637 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TspoP50637 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TspoP50637 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TspoP50637 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TspoP50637 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TspoP50637 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TspoP50637 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TspoP50637 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TspoP50637 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TspoP50637 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TspoP50637 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TspoP50637 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TspoP50637 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TspoP50637 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TspoP50637 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TspoP50637 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TspoP50637 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TspoP50637 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TspoP50637 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TspoP50637 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TspoP50637 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TspoP50637 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TspoP50637 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TspoP50637 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TspoP50637 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TspoP50637 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TspoP50637 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TspoP50637 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TspoP50637 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TspoP50637 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TspoP50637 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TspoP50637 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TspoP50637 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TspoP50637 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TspoP50637 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TspoP50637 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TspoP50637 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TspoP50637 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TspoP50637 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TspoP50637 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TspoP50637 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TspoP50637 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TspoP50637 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TspoP50637 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TspoP50637 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TspoP50637 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TspoP50637 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TspoP50637 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TspoP50637 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TspoP50637 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TspoP50637 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TspoP50637 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms