Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FmodP50608 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FmodP50608 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FmodP50608 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FmodP50608 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FmodP50608 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FmodP50608 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FmodP50608 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FmodP50608 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FmodP50608 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FmodP50608 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FmodP50608 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FmodP50608 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FmodP50608 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FmodP50608 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FmodP50608 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FmodP50608 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FmodP50608 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FmodP50608 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FmodP50608 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FmodP50608 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FmodP50608 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FmodP50608 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FmodP50608 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FmodP50608 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FmodP50608 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FmodP50608 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FmodP50608 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FmodP50608 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FmodP50608 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FmodP50608 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FmodP50608 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FmodP50608 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FmodP50608 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FmodP50608 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FmodP50608 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FmodP50608 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FmodP50608 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FmodP50608 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FmodP50608 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FmodP50608 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FmodP50608 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FmodP50608 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FmodP50608 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FmodP50608 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FmodP50608 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FmodP50608 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FmodP50608 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FmodP50608 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FmodP50608 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FmodP50608 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FmodP50608 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FmodP50608 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FmodP50608 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FmodP50608 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FmodP50608 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FmodP50608 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FmodP50608 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FmodP50608 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FmodP50608 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FmodP50608 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FmodP50608 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FmodP50608 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FmodP50608 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FmodP50608 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FmodP50608 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FmodP50608 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FmodP50608 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FmodP50608 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FmodP50608 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FmodP50608 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FmodP50608 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FmodP50608 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FmodP50608 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FmodP50608 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FmodP50608 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FmodP50608 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FmodP50608 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FmodP50608 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FmodP50608 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FmodP50608 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FmodP50608 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FmodP50608 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FmodP50608 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FmodP50608 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FmodP50608 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FmodP50608 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FmodP50608 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FmodP50608 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FmodP50608 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FmodP50608 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FmodP50608 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FmodP50608 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FmodP50608 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FmodP50608 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FmodP50608 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FmodP50608 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FmodP50608 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FmodP50608 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FmodP50608 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms