Protein–RNA interactions for Protein: P50396

Gdi1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdi1P50396 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gdi1P50396 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gdi1P50396 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gdi1P50396 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms