Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VegfbP49766 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VegfbP49766 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VegfbP49766 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VegfbP49766 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VegfbP49766 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VegfbP49766 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VegfbP49766 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VegfbP49766 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VegfbP49766 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VegfbP49766 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VegfbP49766 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VegfbP49766 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VegfbP49766 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VegfbP49766 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VegfbP49766 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VegfbP49766 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VegfbP49766 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VegfbP49766 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VegfbP49766 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VegfbP49766 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VegfbP49766 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VegfbP49766 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VegfbP49766 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VegfbP49766 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VegfbP49766 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VegfbP49766 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VegfbP49766 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VegfbP49766 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VegfbP49766 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VegfbP49766 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VegfbP49766 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VegfbP49766 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VegfbP49766 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VegfbP49766 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VegfbP49766 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VegfbP49766 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VegfbP49766 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VegfbP49766 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VegfbP49766 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VegfbP49766 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VegfbP49766 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VegfbP49766 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms