Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Brca1P48754 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brca1P48754 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brca1P48754 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Brca1P48754 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brca1P48754 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brca1P48754 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Brca1P48754 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Brca1P48754 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brca1P48754 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Brca1P48754 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Brca1P48754 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Brca1P48754 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Brca1P48754 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms