Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PcntP48725 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PcntP48725 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PcntP48725 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PcntP48725 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PcntP48725 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PcntP48725 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PcntP48725 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PcntP48725 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PcntP48725 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PcntP48725 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PcntP48725 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PcntP48725 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PcntP48725 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PcntP48725 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PcntP48725 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PcntP48725 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PcntP48725 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PcntP48725 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PcntP48725 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PcntP48725 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PcntP48725 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PcntP48725 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PcntP48725 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PcntP48725 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PcntP48725 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PcntP48725 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PcntP48725 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PcntP48725 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PcntP48725 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PcntP48725 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PcntP48725 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PcntP48725 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PcntP48725 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PcntP48725 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PcntP48725 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PcntP48725 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PcntP48725 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PcntP48725 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PcntP48725 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PcntP48725 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PcntP48725 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PcntP48725 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PcntP48725 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PcntP48725 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PcntP48725 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PcntP48725 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PcntP48725 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PcntP48725 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PcntP48725 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PcntP48725 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PcntP48725 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PcntP48725 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PcntP48725 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PcntP48725 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PcntP48725 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PcntP48725 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PcntP48725 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PcntP48725 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PcntP48725 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PcntP48725 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PcntP48725 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PcntP48725 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PcntP48725 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PcntP48725 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PcntP48725 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PcntP48725 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PcntP48725 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PcntP48725 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PcntP48725 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PcntP48725 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PcntP48725 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PcntP48725 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PcntP48725 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PcntP48725 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PcntP48725 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PcntP48725 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PcntP48725 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PcntP48725 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PcntP48725 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PcntP48725 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PcntP48725 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PcntP48725 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PcntP48725 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PcntP48725 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PcntP48725 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PcntP48725 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PcntP48725 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PcntP48725 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PcntP48725 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PcntP48725 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PcntP48725 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PcntP48725 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PcntP48725 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PcntP48725 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PcntP48725 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PcntP48725 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PcntP48725 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PcntP48725 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PcntP48725 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms