Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rfx2P48379 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rfx2P48379 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfx2P48379 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms