Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gbx2P48031 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbx2P48031 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbx2P48031 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms