Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Resp18P47939 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Resp18P47939 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Resp18P47939 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Resp18P47939 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Resp18P47939 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Resp18P47939 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Resp18P47939 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Resp18P47939 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Resp18P47939 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Resp18P47939 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Resp18P47939 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Resp18P47939 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Resp18P47939 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Resp18P47939 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Resp18P47939 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Resp18P47939 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Resp18P47939 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Resp18P47939 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Resp18P47939 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Resp18P47939 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Resp18P47939 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Resp18P47939 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Resp18P47939 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Resp18P47939 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Resp18P47939 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Resp18P47939 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Resp18P47939 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Resp18P47939 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Resp18P47939 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Resp18P47939 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Resp18P47939 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Resp18P47939 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Resp18P47939 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Resp18P47939 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Resp18P47939 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Resp18P47939 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Resp18P47939 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms