Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PfkmP47857 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PfkmP47857 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PfkmP47857 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PfkmP47857 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PfkmP47857 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PfkmP47857 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PfkmP47857 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PfkmP47857 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PfkmP47857 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PfkmP47857 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PfkmP47857 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PfkmP47857 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PfkmP47857 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PfkmP47857 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PfkmP47857 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms