Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SrprbP47758 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SrprbP47758 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SrprbP47758 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SrprbP47758 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SrprbP47758 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SrprbP47758 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SrprbP47758 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SrprbP47758 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SrprbP47758 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrprbP47758 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SrprbP47758 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SrprbP47758 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms