Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax9P47242 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax9P47242 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pax9P47242 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax9P47242 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax9P47242 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax9P47242 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pax9P47242 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax9P47242 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax9P47242 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pax9P47242 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms